在单一的小鼠背景上完成的基因修饰，且在繁育过程中未引入其它品系，那么就可用品系全称或者简写来表示。

这里被修饰的基因一般写的是NCBI中的Official Symbol，而不是Official Full Name哦。

Official Symbol一般是基因的简称，如Igf1；Official Full Name是基因的全名，如insulin-like growth factor 1。

这里特别提一下定点过表达的这类情况，目前Rosa26位点和H11位点是最常用的两个定点过表达整合位点。

Rosa26是一个基因，可以直接用它的Official Symbol：Gt(ROSA)26Sor。

H11并不是某个基因，而是存在于两个基因之间的一个特定染色体位置，所以没有Official Symbol。目前公认的命名是Igs2，表示intergenic site 2的缩写。

tm：对于ES细胞打靶途径获得的品系，用tm表示targeted mutation。

em：对于CRISPR/Cas9或Talen等核酸酶系统介导的基因修饰品系，用em表示endonuclease-mediated mutation。

这里的编号是指在该实验室中，对该基因修饰的序列号。

如：C57BL/6Smoc-Trp53^em5Smoc表示在Smoc实验室对Trp53基因进行的第5次突变。

有时候会看到 tm1.1、tm1.2的情况，这又是什么意思呢？

这是指条件性基因敲除小鼠在与生殖系重组酶工具鼠交配后获得的子代小鼠品系，为了与亲代CKO小鼠（编号为tm1）区分。

敲入的基因，在括号内写明插入的外源基因，如：C57BL/6Smoc-Pvalb^{em1(T2A-iCre)Smoc}。

基因敲除和条件性基因敲除，在命名中一般不加入插入结构的部分，即编号后紧跟实验室代号，如：B6.129-Trp53^tm1Smoc。

一般实验室代号是机构名称的首字母缩写。如：Smoc代表Shanghai Model Organisms Center。你们的实验室有没有代号呢，可以取一个哦~

Tg（Transgene）代表转基因，如果使用转座子系统来制备转基因小鼠的话，那么命名时需在Tg后面加Tn（transposable element）。如：C57BL/6Smoc-Tgtn(pWap-ERBB2)1Smoc

在括号中写明转入的基因启动子信息以及Official Symbol。

用加、减号上标来表示（上标中“+”代表wild type）。

纯合子：Sec16a^-/-。

杂合子：Sec16a^+/-。

野生型：Sec16a^+/+或WT (wild type)。

将敲入的元件写在上标里或者直接用「-」连接。（上标中“+”代表wild type）

Shh基因E177A点突变杂合子：Shh^E177A/+。

Shh敲入Cre重组酶基因，可写成Shh^Cre/+，或者也可直接写成Shh-Cre。

Shh敲入报告基因EGFP，可写成Shh^EGFP/+，或者也可直接写成Shh-EGFP。

对于在安全位点后敲入的，可按下面的例子进行书写。

Rosa26后敲入CAG-LSL-zsGreen，可写成R26^{CAG-LSL-zsGreen/+}，或者直接写成R26-CAG-LSL-zsGreen。当该小鼠与Cre小鼠交配后，Cre介导的重组驱动CAG启动子转录，表达强的zsGreen荧光，则可写成R26^{CAG-LSL-zsGreen/+};Dppa3^Cre/+，或者直接写成R26-CAG-LSL-zsGreen;Dppa3-Cre。

Flox小鼠，将flox作为上标来表示。（上标中“+”代表wild type）

纯合子：Tlr5^flox/flox或Tlr5^f/f。

杂合子：Tlr5^flox/+或Tlr5^f/+。

与广泛表达Cre或生殖系表达Cre工具鼠交配所获得的全身敲除小鼠，可按基因敲除小鼠的规则来简写。

与组织特异性Cre小鼠交配所获得的条件性敲除小鼠，则需要分别表示。如：

Tlr5^flox/flox小鼠分别与小肠上皮细胞（IEC）特异性Cre（Vil1-Cre）、DC细胞特异性Cre（Cd11c-Cre）交配，所获得的基因敲除纯合子小鼠可以分别表示为Tlr5^flox/flox; Vil1-Cre和Tlr5^flox/flox;Cd11c-Cre。如果觉得这样写太麻烦，也可表示为Tlr5^ΔIEC和Tlr5^ΔDC。

小编也在一些文献中看见过其他写法，如最近的一篇《Nature》中写的是Lyz2-cre⁺Aars2^fl/fl，Lyz2-cre^–Aars2^fl/fl，此处的“+”、“-”代表的是Cre阳性和Cre阴性，大家阅读文献的时候一定要根据文章进行判断，注意不要混淆哦~

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41586-024-07992-y#Sec11

一般直接写出表达的基因结构。

Villin promoter驱动EGFP报告基因的转基因小鼠就可以表示为Vil-EGFP。

上海南方模式生物科技股份有限公司（Shanghai Model Organisms Center, Inc.，简称"南模生物"），成立于2000年9月，是一家上交所科创板上市高科技生物公司（股票代码：688265），始终以编辑基因、解码生命为己任，专注于模式生物领域，打造了以基因修饰动物模型研发为核心，涵盖多物种模型构建、饲养繁育、表型分析、药物临床前评价等多个技术平台，致力于为全球高校、科研院所、制药企业等客户提供全方位、一体化的基因修饰动物模型产品解决方案。