8.31 | 小鼠“扰动图谱”讲座
要阐明小鼠基因功能,需要将其在小鼠敲除(扰动),观察其结果。 长期以来,我们对小鼠基因功能的研究处于低通量的水平,每次只能敲除、表征一个基因。而小鼠体内编码蛋白的基因有2万个,可以想象基因研究花费的时间之长、费用之高、速度之慢。
那如何高通量地完成小鼠基因功能研究?上海科技大学池天课题组融合Cre 和 Cas9 这两大体系,成功研发了高通量体内原位基因解码策略iMAP(inducible Mosaic Animal for Perturbation),并快速鉴定了90个基因在39种组织的基本功能,构建了世界首张小鼠“扰动图谱”。这项工作于今年7月份发表在Cell杂志上:Large-Scale Multiplexed Mosaic CRISPR Perturbation in the Whole Organism 。
本期《遇见科学家》栏目,我们非常荣幸邀请到上海科技大学池天教授做客南模生物直播间,同大家介绍iMAP的原理和应用。通过本次公益分享,我们期望与更多学者进行学术交流,共同促进基因生物学领域的研究。
讲座时间
2022年8月31日 19:00
课程简介
探索小鼠基因功能的突破性工具——iMAP
1. iMAP原理
2. 应用举例
2.1 扰动图谱:单个品系揭示上百个基因在全身各种组织的功能
2.2 原位CRISPR筛选:快速发现肿瘤免疫疗法新靶点
2.3单基因打靶品系制备:高通量、廉价、快速
3. 前景
3.1 全基因组、泛组织、单细胞水平的扰动图谱
3.2 系统性筛选药物靶点和发现老药新用途
3.3 覆盖全基因组的条件性单基因打靶品系
嘉宾简介
池天 教授
上海科技大学-生命科学与技术学院
1987年本科毕业于复旦大学。1996年博士毕业于美国加州大学洛杉矶分校。1996至2003年在美国斯坦福大学从事博士后研究。2003-年至历任耶鲁大学助理教授、副教授、研究科学家、客座教授。2015年至今任上海科技大学教授。
研究方向:基因功能与技术 ,肿瘤免疫疗法
池天课题组长期关注技术革新,研发了一系列基因解码、操纵技术,包括条件性点突变、可逆打靶和碱基编辑,并将其用于科学发现。目前聚焦以下课题:
描绘全基因组、泛组织、单细胞水平的“扰动图谱”:利用iMAP,在单细胞水平揭示小鼠2万个蛋白编码基因敲除后分别对全身500多种细胞的影响,从而使今后探索基因的基本功能变得像查找基因序列一样简单。
发现疾病新靶点,实现老药新用:很多疾病难以治疗, 原因是靶点不明,或者靶点已知但缺乏安全有效的药物。拟利用iMAP,发现疾病靶点,同时探索老药靶点在疾病中的新作用,实现“老药新用”,从而跳出新药研发之漫长、昂贵、痛苦的历程。
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